Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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