Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC026333.4-201ENST00000613543 544 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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