Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms