Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDGFDQ9GZP0 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms