Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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