Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USF2Q15853 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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