Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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