Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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SIX1Q15475 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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SIX1Q15475 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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