Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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