Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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