Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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