Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRAF1Q13077 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.6 ms