Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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