Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms