Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms