Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TTPAP49638 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms