Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NMBRP28336 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NMBRP28336 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NMBRP28336 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms