Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms