Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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