Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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