Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms