Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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