Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms