Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NELL1-203ENST00000357134 3022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC091304.1-201ENST00000564897 3034 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CCDC25-201ENST00000356537 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CALCOCO1-210ENST00000548263 3888 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PAPPA2-201ENST00000367661 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FCRL4-201ENST00000271532 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF780A-206ENST00000595687 3472 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PRR27-202ENST00000502294 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 NOL10-202ENST00000381685 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC105105.1-201ENST00000591360 2553 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 DCAF1-201ENST00000335891 4114 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 POLR3B-202ENST00000539066 4118 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CAST-244ENST00000515663 1473 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PPP3CA-205ENST00000507176 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 GSTCD-211ENST00000515279 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC090525.2-201ENST00000551685 2270 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CSTL1-201ENST00000246020 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 IDSP1-201ENST00000324799 376 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CSTL1-202ENST00000347397 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 MIR1306-201ENST00000408439 85 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LINC01655-201ENST00000431729 423 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC092803.1-201ENST00000439570 359 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC138356.2-201ENST00000521192 667 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC011767.1-203ENST00000559762 529 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 MIR6892-201ENST00000612346 115 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC145285.8-201ENST00000619561 255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC025279.3-201ENST00000622398 104 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ITFG2-AS1-202ENST00000636122 962 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF189-204ENST00000615466 2316 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RSU1-205ENST00000602389 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FAM74A4-203ENST00000621724 1862 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SAYSD1-202ENST00000373249 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 BRDT-203ENST00000370389 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PDE4D-207ENST00000405755 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ITGB1BP2-205ENST00000538820 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 BTN2A3P-204ENST00000466808 2559 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 KIF24-201ENST00000379174 5729 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC048380.2-201ENST00000624725 3548 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 DYNLRB1-201ENST00000300469 1464 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 NDUFS1-203ENST00000432169 2080 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LINC00870-202ENST00000473713 2693 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 KCNA2-203ENST00000485317 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 MTMR2-204ENST00000409459 3420 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TFF1-201ENST00000291527 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TAS2R60-201ENST00000332690 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC009967.1-201ENST00000379462 793 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms