Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DRICH1-202ENST00000614553 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC010332.1-201ENST00000620439 97 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SLC24A1-203ENST00000399033 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL137145.2-201ENST00000399868 3086 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ADGRF1-201ENST00000283297 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CCDC15-201ENST00000344762 3893 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZKSCAN5-203ENST00000451158 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL606760.4-201ENST00000617613 718 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SCOC-AS1-201ENST00000512692 1987 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 STAT4-201ENST00000358470 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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