Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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