Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms