Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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