Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRCP08575 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTPRCP08575 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTPRCP08575 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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