Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CUX2O14529 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
CUX2O14529 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CUX2O14529 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CUX2O14529 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CUX2O14529 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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