Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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