Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AP003174.3-201ENST00000537926 516 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC006449.1-201ENST00000616263 571 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FAM182A-201ENST00000376398 5070 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL031676.1-201ENST00000412519 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LANCL1-201ENST00000233714 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL022332.1-201ENST00000411511 428 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC022778.1-201ENST00000518302 545 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms