Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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