Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms