Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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