Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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