Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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