Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms