Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms