Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GPC5P78333 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GPC5P78333 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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