Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms