Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SCN11AQ9UI33 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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