Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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SIX1Q15475 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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SIX1Q15475 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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SIX1Q15475 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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