Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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