Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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