Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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