Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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