Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms