Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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