Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms